La première pierre est posée le [3] par Emmanuel Macron, président de la République française, et Tedros Adhanom Ghebreyesus, directeur général de l'OMS[4]. Elle ouvre officiellement ses portes le 17 décembre 2024 dans un immeuble de sept étages et de 11 000 m2 construit pour l'occasion dans le quartier de Gerland, à Lyon[5],[6]. Toutefois, elle avait déjà débutée ses activités à travers divers outils numériques, notamment des cours en ligne[7],[8].
L'Académie permet la formation internationale continue en présence pour les formateurs et décideurs et à distance pour les autres professionnels de santé. Elle compte également une salle de formation du centre d'opération d'urgence et un plateau de simulation technique d'urgence de 1 500 m2[9],[10]. Elle a pour objectif de former 16 000 personnes toute les années en anglais, français, arabe, chinois, espagnol et russe, et l'OMS souhaite parvenir à toucher trois millions de personnes d'ici 2028 avec la plate-forme en ligne de l'Académie[5], dans 172 pays[11]. L'Académie a également pour objectif de faire face à un futur déficit de personnel de santé, estimé à 10 millions d'ici 2030, dont 5 millions en Afrique[12],[13].
La docteure Agnès Buzyn a été nommée directrice exécutive de l’Académie et a pris ses fonctions le [3]. David Atchorarena lui succède à ce poste[15].
Le bâtiment, situé dans le bio-district du quartier de Gerland, a été financé par l'État français à la hauteur de 85 millions d'euros et par la Métropole de Lyon, la Ville de Lyon pour 10 millions à elles deux[16] et la Région Auvergne-Rhône-Alpes pour les 25 millions restants, cette dernière étant propriétaire du bâtiment, gracieusement mis à disposition de l'OMS[17].