La 59e armée est créée le et placée sous le contrôle de la 15e armée régionale dans le cadre des tentatives désespérées du Japon d'empêcher une invasion américaine de la région de San'yō(en) durant l'opération Downfall. Elle est principalement composée de réservistes sous-entraînés, d'étudiants conscrits, et de miliciens locaux des corps combattants des citoyens patriotiques. Basée à Hiroshima, la majeure partie des membres de son commandement, dont son commandant, le lieutenant-général Yoji Fujii, est tuée lors du bombardement atomique de Hiroshima. D'autres unités de combat telles que la deuxième armée générale, et la 5e division, sont également touchées, et une estimation de 20 000 soldats japonais sont tués. Les survivants de la 59e armée tentent de mener des opérations de secours et de maintenir l'ordre public dans la ville dévastée sans grand succès. Elle est officiellement dissoute au moment de la reddition du Japon le sans avoir combattu.
Edward J. Drea, In the Service of the Emperor : Essays on the Imperial Japanese Army, University of Nebraska Press, (ISBN0-8032-1708-0), « Japanese Preparations for the Defense of the Homeland & Intelligence Forecasting for the Invasion of Japan »