Créée le à Taipei, la 50e division utilise un bâtiment précédemment utilisé par la 48e division et est l'une des deux seules divisions japonaises (avec la 66e division) à être formées à Taïwan. Elle est composée des survivants de la 48e division qui ont été rapatriés à Taïwan.
La 50e division est affectée en permanence sous le contrôle de la 10e armée régionale (et de la 40e armée début 1945).
Durant l'année 1945, la division est installée dans une position fortifiée à Kaohsiung sur la côte sud de Taïwan dans l'attente d'une invasion américaine. Elle est dissoute peu après la reddition du Japon le sans avoir combattu.
W. Victor Madej, Japanese Armed Forces Order of Battle 1939 - 1945. Volume I, Allentown, Game Marketing Company, .
(en) Kengoro Tanaka, Operations of the Imperial Japanese Armed Forces in the Papua New Guinea Theater During World War II, Tokyo, Japan, Japan Papua New Guinea Goodwill Society, (OCLC9206229).
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