Elle est située en face de la ville de Il-Gżira dont elle dépend administrativement et à laquelle est reliée par un pont. Cette dernière lui doit également son nom puisque Gżira signifie « île » en maltais.
Elle était autrefois baptisée en italien : Isola del Vescovo ou en maltais : il-Gżira tal-Isqof, ce qui signifie : « île de l'Évêque ».
Le nom actuel de l'île a été donné en l'honneur d'António Manoel de Vilhena, 66e grand maître de l'Ordre au XVIIIe siècle qui y érigea le fort Manoel qui se trouve à sa pointe est.
