Le monastère et l'église ont été construits par Giacomina Boncio avec la règle de Saint Augustin sur un terrain qui lui fut cédé par Ginevra Gradenigo.
Monastère et église furent reconstruits trois siècles plus tard, et l'église fut achevée et consacrée en 1529.
Elle fut initialement dédiée à Santa Maria et San Giacomo.
À l'intérieur figurent, entre autres, deux tableaux du peintre vénitien Francesco Zugno (1709-1787), Le Christ guérissant les Dix lépreux et la Guérison du Paralytique.
Le monastère, qui dépendait directement du Saint-Siège et jouissent de grands privilèges et exemptions, fut exproprié le , par décret royal du , et supprimé le . En 1832, il fut même démoli.
L'église a été fermée en 1848 parce qu'elle menaça de s'effondrer. Elle fut rouverte en 1863. Récemment, elle fut soumis à une restauration en profondeur.