Abe teki debyyttinsä elokuussa 1998 JEF Unitedin edustusjoukkueessa 16 vuoden ikäisenä ja oli historian nuorin japanilainen ammattilaispelaaja J. Leaguessa. Hänestä tuli JEF Unitedin kapteeni ja vuosina 2005 ja 2006 hän johdatti joukkueen J. Leaguen Cupin voittajaksi.
Maajoukkueura
Maajoukkuedebyyttinsä Abe teki tammikuussa 2005 ystävyysottelussa Kazakstania vastaan. Ensimmäisen maajoukkuemaalinsa hän teki syyskuussa 2006 Jemeniä vastaan. Häntä ei valittu Japanin joukkueeseen 2006 MM-kisoihin, mutta hän pääsi joukkueeseen 2010 kisoihin.