Vuonna 2016 Alaska Airlines julkisti ostavansa yhtiön. Vuoteen 2019 mennessä jo useita Virgin American koneita on Alaska Airlinesin väreissä, ja fuusioitumisen myötä Alaska Airlines julkisti uuden erikoisvärityksen ”More to Love”:n. Väritys kuvastaa kahden yhtiön fuusioitumista, ja se on maalattu useisiin Boeing 737 ja Airbus A321 -koneisiin. Virgin American lennonhallintakeskus sijaitsee San Franciscossa, ja sieltä yhä hallitaan Virgin American vanhoja koneita. Tavoitteena on ohjata kaikki lennot Alaska Airlinesin lennonhallintakeskukselta Seattle-Tacoman kansainväliseltä lentoasemalta kun fuusioituminen on valmis. Kaikissa Virgin American omistamissa Airbus-koneissa pitäisi olla Alaska Airlinesin värit ja matkustamo vuoden 2020-alkupuolella.
