Scooby-Doo! Mystery Incorporated on Warner Bros. Animationin tuottama yhdysvaltalainenanimaatiosarja, joka on samalla yhdestoista Scooby-Doo-televisiosarja. Sarja ei ole jatkoa edellisille sarjoille ja se on tarkoitettu hivenen vanhemmalle yleisölle toisin kuin edellinen sarja. Mystery Incorporatedia tuotettiin yhteensä 52 jaksoa. Ensimmäinen jakso esitettiin ennakkoon Yhdysvalloissa 5. huhtikuuta 2010, mutta varsinaisesti sarjan esittäminen aloitettiin 12. heinäkuuta 2010 Cartoon Networkilla.
Fred Jones, Daphne Blake, Velma Dinkley, Shaggy Rogers ja Scooby-Doo ovat mysteereitä ratkovia teini-ikäisiä freelancer-etsiviä, jotka asuvat pienessä kaupungissa nimeltä Crystal Cove. Kaupunkia pidetään kummittelevimpana paikkana maan päällä ja erityisesti sen pitkän historian ansiosta kaupunki vetää turisteja paikalle. Mysteeripoppoon vanhemmat eivät kuitenkaan katso hyvällä lapsiensa tapaa tutkia yliluonnollisia ja aavemaisia mysteereitä. Lisäksi paikallinen sheriffi Stone ei myöskään ole kiitollinen nuorten tavasta tutkia heille kuulumattomia asioita. Useimmiten vanhojen sarjojen tapaan kaikki kaupunkia pelotelleet kummitukset ja hirviöt ovat rikollisten naamioasuja, joilla he yrittävät saavuttaa motiivinsa. He saavat kuitenkin kohdata suurimman mysteerinsä, kun kasvoton salaperäinen Mr. E jättää heille kryptisiä vihjeitä. Ryhmä saa pian huomata vuosikymmenen vanhan mysteerin, jossa neljä mysteereitä ratkonneita nuoria katosivat. Mysteeri on edelleen ratkaisematon ja Mysteeripoppoon tietämättä Mr. E:n mielestä nyt on oikea hetki ratkoa se.
Sivujuonena sarja keskittyy myös hahmojen välisiin suhteisiin, jossa Daphne yrittää saada romanttisemman suhteen aikaan Fredin kanssa. Lisäksi Scooby-Doo-sarjoissa ensimmäistä kertaa Velma osoittaa kiinnostusta Shaggya kohtaan, joka puolestaan yrittää salata heidän välisen suhteen parhaalta ystävältään Scooby-Doolta.