Vuonna 1962 Augstein oli pidätettynä 103 päivää. Häntä epäiltiin maanpetoksesta, koska lehdessä oli julkaistu yksityiskohtaisia tietoja Länsi-Saksan puolustusvoimista. Puolustusministeri Franz Josef Strauß joutui eroamaan, ja Adenauerin IV hallitus kaatui.[4][5]
1980-luvulla Augstein osallistui laajakantoiseen kiistaan, joka koski holokaustin historiallisia tulkintoja ja saksalaisten menneisyyssuhdetta. Hän nimitti Kölnin yliopiston silloista historian professoria ”perustuslailliseksi natsiksi”.[6]
Augstein oli viisi kertaa naimisissa ja hänellä oli neljä lasta.[1]