Hän voitti elokuvallaan Casablancan katupojat (2001) Afrikan arvostetuimpiin elokuvapalkintoihin kuuluvan FESPACO:n Yennengan kultaisen oriin (2001). Nabil Ayouchin pikkuveli, toimittaja-elokuvantekijä Hicham Ayouch palkittiin samalla palkinnolla 2015.
Ayouchin uudemmat elokuvat ovat herättäneet kohua ja joutuneet sensuroiduksi ainakin joissain Pohjois-Afrikan maissa. Ayouchin marokkolaisia prostitutioituja käsittelevän Much loved -elokuvan (2015) keskeneräistä materiaalia vuodettiin sosiaaliseen mediaan, tekijöitä uhkailtiin, ja eräs elokuvan päänäyttelijöistä joutui väkivallan uhriksi (ja muutti kotimaastaan Ranskaan). Elokuva kiellettiin Marokossa ja elokuvan tekijöitä haastettiin siveellisyyttä käsittelevään oikeudenistuntoon. Much loved -elokuva palkittiin parhaalle ranskankieliselle elokuvalle myönnetyllä Prix Lumières -palkinnolla (2016).[3][4][5]Razzia-elokuva (2017) joutui sensuurin kohteeksi ja kiellettiin Egyptissä muutamaa päivää ennen kevääksi 2018 suunniteltua paikallista ensi-iltaa. Elokuvassa sosiaalisesti aktiiviset nuoret aikuiset haluavat vapautua, mikä saatettiin tulkita arabikevään jälkeisessä Egyptin konservatiivisemmassa poliittisessa ilmapiirissä mahdollisena yhteiskunnallisena uhkana.[3][6]