Muskogee-kielet ovat Yhdysvalloissa puhuttuja intiaanikieliä.[1] Kielikunta jaetaan yleensä kahteen eri osaan, itäisiin ja läntisiin muskogee-kieliin. Tämä jako on kuitenkin kiistanalainen ja epäselvä. Jaon kehitti kielitieteilijä Mary Haas.
Yhdysvaltalainen kielitieteilijä Pamela Munro on ehdottanut, että kielet jaettaisiin pohjoisiin ja eteläisiin kieliin. Hänen jakonsa on kuitenkin harvemmin käytetty. Kielillä arvioidaan olevan yhteensä 15 300 puhujaa.
