Mežduretšensk sijaitsee Kuznetskin hiililaakiolla (Kuzbass) ja se perustettiin vuonna 1946 nimellä Olžeras Tomusinski 1-2 -kaivoksen yhteyteen. Vuonna 1955 asutus ja vastakkaiselle rannalle rakennettu kaupunki yhdistettiin nykyiselle nimelleen.
Toukokuun 8.–9. 2010 kaupungin pohjoispuolella sijaitsevassa Raspadskaja-yhtiön kaivoksessa, joka on kooltaan maailman 9. suurin hiilikaivos,[1] tapahtui kaivosonnettomuus, jossa kuoli 90 kaivosmiestä.[2][3]