Aleksanteri-instituutissa Kangaspuron tehtäviin kuuluvat muun muassa Venäjän ja itäisen Euroopan tutkimukseen keskittyvän tutkimusohjelman kehittäminen ja toteuttaminen.[3]
Kangaspuro toimi vuosina 2002–2014 Venäjän ja itäisen Keski-Euroopan tutkimukseen erikoistuneen tieteellisen aikakauskirjan Idäntutkimuksen päätoimittajana.
Kangaspuro suhtautuu kielteisesti Suomen Nato-jäsenyyteen.[4][5] Vuonna 2014 Itä-Ukrainan sodan yhteydessä hän totesi Venäjän yrittävän rauhoitella tilannetta Ukrainassa ja syytti sodan kärjistymisestä muun muassa Yhdysvaltoja.[5] Ennen Itä-Ukrainan taistelujen alkamista hän arvioi huhtikuussa 2014, että aseelliseen voimankäyttöön turvautuminen kriisissä johtaa todennäköisesti Venäjän suoraan sekaantumiseen konfliktiin.[6]
Teoksia
Kangaspuro, Markku: Neuvosto-Karjalan taistelu itsehallinnosta : nationalismi ja suomalaiset punaiset Neuvostoliiton vallankäytössä vuosina 1920-1939. Suomalaisen Kirjallisuuden Seura, 2000. Bibliotheca historica, ISSN 1238-3503
Kangaspuro, Markku .. et al.: Islam Venäjällä. Helsinki: Venäjän ja Itä-Euroopan tutkimuksen seura, 2002. Idäntutkimus, ISSN 1237-6051 ; 2/2002
Kangaspuro, Markku; Smith, Jeremy: Modernisation in Russia since 1900. Suomalaisen Kirjallisuuden Seura, 2006. ISBN 951-746-854-7