Keisarillinen krypta (saks. Kaisergruft tai Kapuzinergruft) on Kapusiinikirkossa ja -luostarissa Wienissä Itävallassa sijaitseva hautakammio.

Kirkko rakennettiin vuosina 1622–1632 ja vuodesta 1618 lähtien se on ollut Habsburg suvun jäsenten pääasiallinen hautapaikka.^[1] Kryptaan on haudattu 150 Habsburg suvun jäsentä, joista 12 on keisareita ja 22 keisarinnoja ja kuningatarta.^[2][3]

• Keisari Matias
• Keisari Ferdinand III
• Keisari Leopold I
• Keisari Joosef I
• Keisari Kaarle VI
• Keisari Frans I Stefan, Maria Teresian puoliso
• Keisari Joosef II
• Keisari Leopold II
• Keisari Frans II
• Itävallan keisari Ferdinand I
• Keisari Maksimilian I, Meksikon keisari
• Itävallan keisari Frans Joosef I

• Anna Tirolilainen (1585–1618), keisari Matiaksen puoliso
• Maria Anna, keisari Ferdinand III:n 1. puoliso
• Eleonora Magdalena Gonzaga (1630–1686), keisari Ferdinand III:n 3. puoliso
• Maria Leopoldine, keisari Ferdinand III:n 2. puoliso
• Margareeta Teresia, keisari Leopold I:n 1. puoliso
• Eleonoora Magdalena (1655–1720), keisari Leopold I:n 3. puoliso
• Claudia Felicitas (1653–1676), keisari Leopold I:n 2. puoliso
• Elisabet Kristiina, keisari Kaarle VI:n puoliso
• Maria Teresia
• Maria Josefina (1739–1767), keisari Joosef II:n 2. puoliso
• Isabella Maria (1741–1763), keisari Joosef II:n 1. puoliso
• Elisabet Vilhelmine (1767–1790), keisari Frans II:n 1. puoliso
• Maria Teresa, keisari Frans II:n 2. puoliso
• Maria Ludovika (1787–1816), keisari Frans II:n 3. puoliso
• Karoline Augusta (1792–1873), keisari Frans II:n 4. puoliso
• Arkkiherttuatar Marie Louise, Ranskan keisarinna
• Maria Anna, Itävallan keisari Ferdinand I:n puoliso
• Elisabet, Itävallan keisari Frans Joosef I:n puoliso
• Zita, Itävallan keisari Kaarle I:n puoliso

Viimeisimmät kryptaan haudatut ovat arkkiherttua Otto (1912–2011), Itävallan keisari Kaarle I:n vanhin poika ja kruununperijä, joka luopui vaateestaan vuonna 1961 ja jonka vuonna 1979 saksalaiset äänestäjät valitsivat Euroopan parlamentin jäseneksi, jossa hän toimi useiden uudelleenvalintojen jälkeen pidempään kuin kukaan muu jäsen sekä puoliso arkkiherttuatar Regina (1925–2010). Hautapaikka on varattu arkkiherttuatar, prinsessa Yolande Marie Jeanne Charlotte de Lignelle (1923–2023), arkkiherttua Carl Ludvigin (1918–2007), Kaarle I:n ja keisarinna Zitan neljänneksi vanhimman pojan puolisolle.^[4]

Vuodesta 1971 lähtien suvun jäsenet, kuten Kaarle I:n ja keisarinna Zitan nuorin poika arkkiherttua Rudolf (1919–2010) on enimmäkseen haudattu Sveitsin Murissa sijaitsevan benediktiiniläisluostarin Loretto-kappelin kryptaan, jonka kreivi Radebot von Habsburg perusti vuonna 1027.