Johann Natterer (9. marraskuuta 1787 Laxenburg – 17. kesäkuuta 1843 Wien) oli itävaltalainen tutkimusmatkailija ja eläintieteilijä.

Johann Nattererin vanhemmat olivat eläintieteilijä Joseph Natterer ja Maria Anna Theresia Schober.

Natterer osallistui eläintieteilijänä keisari Frans I:n kustantamalle tutkimusmatkalle Brasiliaan vuonna 1817. Natterer jäi Etelä-Amerikkaan 18 vuodeksi ja palasi Wieniin 1835 mukanaan suuri kokoelma näytteitä, muun muassa 12 293 lintua.^[1] Natterer ei koskaan julkaissut matkansa tuloksia ja hänen päiväkirjansa ja muistivihkonsa tuhoutuivat tulipalossa 1848. 60 000 näytteen hyönteiskokoelma säästyi palolta.

Nattererin ja Alfred Malherben nimeämät uudet lintulajit olivat kastanjatöyhtötikka (Celeus grammicus) ja suomurintatikka (Piculus leucolaemus).^[2]