Satamaan kuuluu ulompi, merenpuoleinen osa ja sisempi satama, joka sijoittuu osin joki- ja kanavaverkon varrelle.[2] Ulompaan satamaan johtaa 17 metrin syväväylä ja se on suunniteltu syväykseltään enintään 15 metrin aluksille; laiturien pituudet vaihtelevat 220 ja 765 metrin väliltä. Satamakanavaan ja Veikselin suistoon sijoituva sisäsatama voi ottaa vastaan enintään 225 metriä pitkiä ja 10,2 metrin syväyksen aluksia.[3] Gdańskin satamaan kuuluu myös vapaasatama, eli sillä on kansallisen tullivyöhykkeen ulkopuolinen vapaa-alue.[2]
Rahdin määrä
Satama on Puolan suurin merisatama niin tonnimääräisen rahtimäärän kuin konttiliikenteenkin osalta. Konttiliikenne kasvoi merkittävästi ulkosatamaan kesällä 2007 avatun, sisäsataman konttiterminaalia laajemman uuden konttiterminaalin myötä. Pelkästään uuden syväsataman konttiterminaalin kautta kulki vuonna 2011 kontteja yli 641 000 TEU:n edestä.[4] Gdańsk ohitti konttivolyymeissä Gdynian sataman vuonna 2010. Itämeren alueella sitä suurempia konttiliikenteen satamia olivat vuonna 2011 Pietarin suursatama ja Göteborgin satama. Vuoden 2012 tammi-syyskuussa Gdańskin syväkonttiterminaali ohitti 646 345 TEU:aan koko vuoden 2011 rahtimääränsä;[5] vuoden 2012 konttirahdissa Gdańsk lähestyy jo Itämeren toiseksi suurimman konttisataman asemaa.