Futsal-Liigan kausi 2016–2017 oli suomalaisen futsalin pääsarjatason 19. kausi. Kausi alkoi 24. syskuuta 2016 ja päättyi viidenteen finaaliin 7. toukokuuta 2017. Hallitsevana mestarina kauteen lähti Sievi FS ja sarjanousijana PJK. Futsal-Liigassa pelattiin 12 osallistuvan joukkueen kesken kaksinkertainen runkosarja, jonka kahdeksan parhaiten sijoittunutta joukkuetta jatkoivat pudotuspeleihin.
Futsal-Liigan mestaruuden kaudella 2016–2017 voitti Sievi FS kukistamalla finaalisarjassa Kampuksen Dynamon otteluvoitoin 3–2. Kauden päätteeksi Tervarit putosi Futsal-Ykköseen.
Tampereella järjestetyssä Futsal-gaalassa palkittiin kauden 2016–2017 parhaita onnistujia. Miesten Futsal-liigan osalta jaettiin seuraavia palkintoja:[2]