Filoktetes sai Herakleen jousen ja nuolet, koska ainoana kykeni sytyttämään hänen hautarovionsa. Filoktetes aikoi hyökätä seitsemällä laivalla Troijaa vastaan, mutta matkalla käärme puri häntä Khrysen saarella. Purema alkoi märkiä ja haista niin pahalle, että miehistö Odysseuksen neuvosta jätti hänet Lemnokselle.
Lemnoksella Filoktetes sai kärsiä yksin kymmenen vuotta, kunnes Odysseus haki hänet. Tietäjä Helenos oli ennustanut, että Troijan sotaa ei voitettaisi ilman Herakleen nuolia. Kun Filoktetes ampui Pariin Herakleen jousella ja nuolilla, Troijan tuho varmistui.