Ruiz Zafón työskenteli ennen kirjallista uraansa useissa mainostoimistoissa.[3] Hänen ensimmäinen romaani El príncipe de la niebla (1993) sai Edebén nuorten aikuisten kirjallisuuden kirjallisuuspalkinnon.[4] Sen lisäksi hän on kirjoittanut kolme muuta nuorten aikuisten romaania: El palacio de la medianoche (1994), Las luces de septiembre (1995) ja Marina (1999, suom.).
Vuonna 2001 ilmestyi Ruiz Zafónin ensimmäinen aikuisille suunnattu romaani La sombra del viento (suom. Tuulen varjo, 2004).[5] Ilmestymisensä jälkeen Tuulen varjo on kerännyt kriitikoilta kehuja kaikkialla maailmassa ja saanut runsaasti palkintoja. Teoksen tapahtumat sijoittuvat Francon kauden alkuvuosiin[6]. Vuonna 2008 ilmestyi Ruiz Zafónin toinen aikuisten romaani El juego del ángel (suom. Enkelipeli, 2009). Sen tapahtumat sijoittuvat 1920- ja 1930-lukujen Barcelonaan. Romaani kertoo nuoresta kirjailijasta, jota salaperäinen hahmo pyytää kirjoittamaan kirjan.[7]
Ruiz Zafón suunnitteli teossarjasta neliosaista, niin että kaikki osat johtavat lopulta hänen luomaansa kuvitteelliseen Barcelonaan.[7] Niin sanotun ”Unohdettujen kirjojen hautausmaa” -sarjan kolmas osa Taivasten vanki ilmestyi vuonna 2011 ja neljäs osa Henkien labyrintti 2016.[4]
Ruiz Zafónin teoksia on julkaistu 45 maassa[4], ja niitä on käännetty yli 40 kielelle. Niitä on maailmanlaajuisesti myyty yli 38 miljoonaa kappaletta.[8] Sen perusteella hän on menestynein espanjalainen nykykirjailija Javier Sierran ja Juan Gómez-Juradoin ohella.
