Bautista on voittanut Meksikon Primera Divisiónin Aperturan osan ensin Pachucan kanssa kaudella 2003–2004 ja myöhemmin Deportivo Guadalajaran kanssa kaudella 2006–2007. Bautista pelasi urallaan yhteensä 468 liigaottelua, joissa hän teki 122 maalia ja syötti 37 kertaa.[1]