El río de las Juntas nace en la sierra de Montillana, en el término municipal de Noalejo, y en su cabecera recibe algunos arroyos procedentes de la sierra del Trigo. Su cauce realiza un recorrido de unos 23 km,[1] primero en dirección nordeste-suroeste hasta el paraje del Llano de las Vegas, donde gira en dirección sureste hasta su desembocadura en el embalse de Colomera después de atravesar la localidad de Benalúa de las Villas. En el mencionado embalse confluye con el río Colomera, del que es afluente.
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