Fue construido por el Ferrocarril Buenos Aires al Pacífico (de ahí su nombre) como parte de la extensión del servicio ferroviario hasta Retiro. Debido a que ya por entonces esa zona, aledaña a los Bosques de Palermo y el hipódromo, era altamente transitada, la empresa decidió construir el trazado en altura para evitar los cruces a nivel. Como resultado de esto se construyeron varios puentes y paseos bajo las vías como el Paseo de la Infanta. El Puente Pacífico forma parte de esa obra, sin ser el puente más grande del recorrido, pero sí el más significativo por su ubicación.
Ensanche
En el año 2011 el Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires realizó una obra de ensanche, la empresa Ausa al realizar la obra permitió ensanchar la Avenida Santa Fe llevándola de 6 carriles a 10. Esto implicó un alargamiento del puente hacia el este. A tal fin se realizó una réplica en metal exacta del decorado del tramo recto que presentaba el puente en sus extremos, por lo cual actualmente el característico arco no se encuentra en el centro del puente, sino hacia el oeste.[1]
A causa de la limitada capacidad que tuvo durante años el entubamiento del Arroyo Maldonado que corre bajo la Avenida Juan B. Justo, esta zona era propensa a inundarse en días de tormentas y caída fuerte de precipitaciones.[2]