Bosnia y Herzegovina es una federación compuesta por dos entidades: la Federación de Bosnia y Herzegovina (azul) y la República Srpska (rosa), tal y como se fijó en los acuerdos de Dayton de 1995.
Los acuerdos de Dayton de 1995 establecieron dos estados «étnicamente puros» (debido a la eliminación física —asesinatos— o a la expulsión de las minorías étnicas entre los habitantes del país). Así surgieron: la República serbobosnia (República Srpska) y la Federación croatobosnia (Federación de Bosnia y Herzegovina). A esta división posteriormente se le sumó la ciudad autónoma de Brčko (DB) en el año 2000, ubicada al NE del país, ocupando zonas de las dos entidades principales del Estado bosnio.
El tercer nivel de la subdivisión político-administrativa de Bosnia y Herzegovina, se manifiesta a través de los cantones, pero estos solo se encuentran en la FBH. Hay diez cantones en la FBH, cada uno de los cuales posee su propio gobierno cantonal, los cuales se encuentran bajo la Constitución de la Federación. Algunos de los cantones poseen distintos componentes étnicos y por ello poseen leyes especiales a fin de equilibrar las fuerzas entre las etnias.
El cuarto nivel en la división política de Bosnia y Herzegovina son las municipalidades. La FBH se divide en 74 municipalidades y la RS en 63. Las Municipalidades, poseen gobiernos locales y comúnmente se expanden alrededor de la ciudad más importante dentro de sus territorios, es así que muchas municipalidades tienen una larga historia y tradición que se expresa en estas divisiones, pero también hay otras que son producto exclusivo de la subdivisión tras la guerra de los años noventa. Cada cantón de la FBH comprende varias municipalidades.
Además de las entidades-estados, los cantones y las municipalidades, Bosnia y Herzegovina también posee cuatro "ciudades oficiales"; las mismas son: Banja Luka, Mostar, Sarajevo y Sarajevo Oriental (Istočno Sarajevo). El territorio de las ciudades de Banja Luka y Mostar corresponde a las municipalidades del mismo nombre, mientras que Sarajevo y Sarajevo Oriental contienen a su vez varias municipalidades. Las ciudades poseen su propio gobierno en las que el poder de las mismas se encuentra en un nivel entre los municipalidades y los cantones (o de la entidad en el caso de la República Srpska).
En su forma de gobierno Bosnia Herzegovina tiene un Parlamento bicameral. El presidente de la República es elegido en un régimen rotativo entre representantes de cada una de las etnias, bosnia, serbia y croata. Las entidades están basadas territorialmente en las posiciones que sobre el terreno tenían las fuerzas que estaban sosteniendo el conflicto armado en el momento en que se firmaron formalmente los Acuerdos de Dayton, en atención a los cambios en la estructura étnica de Bosnia y Herzegovina producto de la guerra.
De los 10 cantones, cinco son de mayoría bosníaca, tres de mayoría croata, y dos son mixtos, lo que significa que existen procedimientos legales para la protección de las etnias constituyentes.
En Bosnia y Herzegovina la unidad territorial más pequeña es el municipio (opština/општина o općina/опћина en el idioma oficial del país). Anteriormente a la guerra de los Balcanes había 109 municipios en Bosnia. Diez de ellos formaban la zona de Sarajevo. Después de la guerra el número de municipios aumentó a 143: 79 en la Federación de Bosnia y Herzegovina y 64 en la República Srpska; el Distrito de Brčko no pertenece a ninguna entidad. En la Federación los municipios son una parte de los cantones, mientras que en la República son una parte de las regiones.
Organización territorial de la Federación de Bosnia y Herzegovina
La Federación de Bosnia y Herzegovina se encuentra subdividida en diez cantones. A su vez, éstos cantones están divididos internamente en numerosas municipalidades.
La República Srpska se encuentra subdividida en sesenta y tres municipios. Estos, a su vez, se encuentran agrupados en siete regiones que forman parte de Bosnia y Herzegovina.