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El 5 de abril de 2011 fue arrestado junto a su hermano A'ala por las autoridades locales y detenidos en una base secreta. Ambos fueron identificados como participantes en la Rebelión en Baréin de 2011-2012 y que ambos habían abandonado al Al-Ahli Manama.[1] El partido político Al Wefaq, la principal fuerza de oposición de Baréin, anunció que Mohamed Hubail fue condenado a dos años de prisión basado en la ley marcial impuesta en marzo de 2011.[2]
El 24 de junio de 2011 la FIFA anunció que por la interferencia del gobierno local en el deporte involucrando futbolistas, entrenadores y árbitros arrestados y suspendidos por protestas antigobierno, suspendería a Baréin de toda actividad relacionada con el fútbol por atentar contra los derechos humanos.[3] El 29 de junio de 2011 se anunció la liberación de los detenidos pero que las detenciones continuarían.[4]