Margarita de Alsacia (1145-Brujas, 15 de noviembre de 1194) fue condesa de Flandes desde 1191 hasta su muerte.
Fue la hija de Teodorico de Alsacia y de Sibila de Anjou, hermana y heredera de Felipe de Alsacia.
En 1169 contrajo nupcias con Balduino V de Henao, quien en 1191 se transformó en cogobernante de Flandes como Balduino VIII. De este matrimonio nacieron los siguientes vástagos: