La deforestación ha afectado negativamente el área de la laguna Cáceres, ya que causa una mayor cantidad de material de arrastre que incrementa la sedimentación de la laguna y sus afluentes. En 2011 y 2012 se alertó que la laguna podría secarse en un lapso de 10 años, y en 2021, la navegación al canal Tamengo desde la laguna Cáceres se hizo imposible debido al bajo nivel del agua.[3]
