La laguna forma parte del Área Protegida Municipal Reserva de Vida Silvestre Laguna Concepción, creada mediante Orden Municipal de Pailón n.° 012/2002, el 29 de julio de 2002 con una superficie de 52.293 ha. Posteriormente, el Gobierno Municipal de San José de Chiquitos emitió la Ordenanza 55/2009 que determina la creación del mismo espacio, ampliando la superficie total a 120.196 ha.[1]
Geografía
Está formada por una laguna con arena blanca en su fondo y por humedales conexos, se caracteriza por superficie llana de bosques y con malezas de drenaje escaso, está situada junto a la serranía Chiquitana. Cuenta con unas dimensiones de 27 km de largo por 10 km de ancho y una superficie que varía de los 58 km² a los 200 km² aproximadamente.
Afluentes y desagües
Por el sur recibe principalmente los aportes hídricos procedentes de los distantes Andes que llegan por el río Parapetí y su continuación, el río Quimone; por el noreste avena y desagua en el gran río San Miguel (curso alto del Itonomas), afluente de la cuenca amazónica.
Sitio Ramsar
Fue declarada Sitio Ramsar el 6 de mayo de 2002, con una superficie de 31 124 hectáreas.
Problemas medioambientales
La laguna Concepción es afectada por la presión de la frontera agrícola en el sector oeste y norte.[1]
Con los años, la diversidad de flora del área se ha ido perdiendo en la medida que se están intensificando las actividades agrícolas y pecuarias. Al 2019, las hectáreas intervenidas por las actividades humanas han alcanzado las 34 094 ha del área protegida. Esta actividad humana es causada debido a que hay colonias menonitas que operan dentro del área protegida y tienen terrenos a cerca de cinco kilómetros del espejo de agua.[2] Debido a los asentamientos y la deforestación de parte de las colonias menonitas, se ha observado que los niveles de agua de la laguna se redujeron considerablemente.[3]