Descripción: Dominios funcionales pertenecientes a la ADN polimerasa I
El fragmento de Klenow es un fragmento proteico de gran tamaño perteneciente a la enzimaDNA polimerasa I, procedente de E. coli. Este fragmento puede separarse del resto de la enzima gracias a la proteasasubtilisina. Publicado por primera vez en 1970,[1] mantiene la actividad polimerasa 5’ → 3’ y la actividad exonucleasa 3’ → 5’ para eliminar nucleótidos previos a la secuencia codificante y corrección de errores, pero pierde su actividad exonucleasa 5' → 3'.
El resto de fragmentos pequeños originados cuando la DNA polimerasa I de E. coli se procesa por subtilisina mantiene la actividad exonucleasa 5'→ 3' pero no tiene las otras dos actividades mostradas por el fragmento Klenow ( i.e. actividad polimerasa 5' → 3', y actividad nucleasa 3' → 5').
Puede ser liberado del resto de la polimerasa mediante tratamiento con tripsina
Investigación
Debido a que la actividad exonucleasa 5' → 3' de la DNA polimerasa I de E. coli la hace ineficaz para muchas aplicaciones, el fragmento Klenow, el cual carece de esta actividad, puede resultar muy útil en investigación. El fragmento Klenow es extremadamente útil para tareas basadas en investigación cómo:
Síntesis de DNA de doble cadena a partir de muestras de cadena simple
El fragmento Klenow fue además la primera enzima usada para amplificar segmentos de DNA en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés),[2] antes de ser reemplazada por enzimas termoestables como la Taq polimerasa.[3]
El fragmento exo- Klenow
Al igual que la actividad exonucleasa 5' → 3' de la DNA polimerasa I de E.coli puede no ser deseable, la actividad exonucleasa 3' → 5' del fragmento Klenow tampoco puede ser deseable para algunas aplicaciones. Este problema puede ser salvado induciendo mutaciones en el gen que codifica para el fragmento. Esto resulta en formas de la enzima que mantienen la actividad polimerasa 5' → 3', pero carecen de cualquier actividad exonucleasa (5' → 3' o 3' → 5'). Esta forma de la enzima es llamada fragmento exo- Klenow.
↑Saiki RK et al. (1985). «Enzymatic Amplification of β-globin Genomic Sequences and Restriction Site Analysis for Diagnosis of Sickle Cell Anemia». Science230: 1350-54. PMID2999980. doi:10.1126/science.2999980.
↑Saiki et al. (1988). «Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase». Science239: 487-91. PMID2448875. doi:10.1126/science.2448875.
