Fernando sucedió a su padre como gran duque de Toscana en 1790, y gobernó hasta 1801, cuando fue obligado por Napoleón a ceder sus dominios a los Borbones de Parma, erigiéndose entonces el Reino de Etruria. Fernando fue compensado con los dominios secularizados del arzobispado de Salzburgo y de otros príncipes eclesiásticos alemanes, y fue elevado a la categoría de príncipe elector del Sacro Imperio Romano Germánico.
Por el Tratado de Presburgo de 1805, Fernando cedió Salzburgo, el que fue anexado por su hermano, Francisco I de Austria, y fue puesto al frente del Ducado de Wurzburgo, un nuevo estado creado para él a partir del Obispado de aquella ciudad. Permaneció en este puesto hasta la caída de Napoleón, en 1814, oportunidad en que retornó a Toscana, la que gobernó hasta su muerte.
Títulos y órdenes
Títulos
● 6 de mayo de 1769-22 de julio de 1790:
Su alteza real el archiduque Fernando de Austria
● 22 de julio de 1790-3 de agosto de 1801:
Su alteza real el gran duque de Toscana
● 1802-1805:
Su alteza real el gran duque de Salzburgo, príncipe elector del Sacro Imperio Romano Germánico
● 1805-1806:
Su alteza real el gran duque de Wurzburgo, príncipe elector del Sacro Imperio Romano Germánico
● 1806-1814:
Su alteza real el gran duque de Wurzburgo
● 27 de abril de 1814-18 de junio de 1824:
Su alteza real el gran duque de Toscana, archiduque de Austria, príncipe real de Hungría y Bohemia [2]
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