Al sur del Sahara, dos cinturones de sabana atraviesan el continente de este a oeste, desde el océano Atlántico hasta el macizo Etíope. Inmediatamente al sur del Sahara se encuentra el Sahel, una zona de transición formada por praderas semiáridas y sabanas de Acacia. Las precipitaciones aumentan hacia el sur en la sabana sudanesa. La sabana sudanesa alberga dos grandes humedales, el Sudd en Sudán del Sur y el delta interior del Níger-Baní en Malí. El mosaico de bosque y sabana es una zona de transición entre las sabanas y la zona selvática ecuatorial.
El reino florístico del Cabo, en el extremo meridional de África, es una región de clima mediterráneo que alberga un número significativo de endemismos, así como familias de plantas, como las proteas (Proteaceae) que también se encuentran en la ecozona australiana.
Madagascar e islas del Índico occidental
Madagascar y las islas vecinas forman una sub-región distinta de la ecozona, con numerosas especies endémicas, como los lémures, y elevada biodiversidad. Madagascar y las Seychelles son restos del antiguo supercontinenteGondwana; se separaron de África hace millones de años. Otras islas del océano Índico, como las Comores y las Mascareñas, son de origen volcánico y de formación más reciente. Algunos biomas:
