Las cuencas costeras entre los ríos Elqui y Limarí es el nombre dado al ítem 044 del inventario de cuencas de Chile que comprende las hoyas hidrográficas ubicadas entre ambos ríos y que desembocan en el océano Pacífico. Cubren un área de 2330 km² en que se encuentran las ciudades de La Serena, Coquimbo y Tongoy.

A partir de los años 70 se ha ampliado el concepto de cuenca hasta entender, ya en los primeros años del siglo XXI, una cuenca hidrográfica en lo que respecta a su definición espacial y funcional, como la unidad geopolítica y socioeconómica más apropiada y racional para el desarrollo integrado de los recursos de tierras y aguas asociados a la vegetación y en conjunto con los usuarios de nivel local y regional.^[1]​^: 17

Limita al noreste con la cuenca del río Elqui, al sur y al este con la cuenca del río Limarí y al oeste con el océano Pacífico.

El sistema de información y monitoreo de biodiversidad del Ministerio del Medio Ambiente de Chile señala la siguiente distribución de la superficie de la cuenca entre las comunas (el porcentaje es de la cuenca):^[2]​

Las ciudades de Andacollo y Ovalle no se ubican dentro del ítem 044.

La Dirección General de Aguas subdivide o reúne las cuencas de Chile acorde a las necesidades de estudio y gestión. Existen dos inventarios que han logrado ser aceptados como principales, el inventario de cuencas del Banco Nacional de Aguas (BNA) de 1978, de mayor uso, y el inventario de cuencas del Departamento de Administración de Recursos Hídricos (DARH) de 2014 de mejor cartografía que ha obligado a redefinir algunos límites, a veces con cambios mayores, pero también por algunas redefiniciones del concepto de subcuenca.

Bajo el BNA el código del ítem es 044 y con el DARH es 0404.

La subdivisión del BNA es como sigue:^[4]​

La disposición de cuencas en el inventario DARH es la siguiente:^[5]​

Entre los Ríos Elqui y Limarí fluyen varias quebradas que descargan en las bahías de Tongoy, Guanaqueros y Coquimbo. Algunas de ellas no llegan con agua al mar en temporadas secas, formando humedales costeros como los de Salinas Chica, Salinas Grande y Pachingo en Bahía de Tongoy, los que fueron declarados Santuarios de la Naturaleza el año 2018.^[3]​^: 2–40

Los cuerpos de agua consuderados en esta categoría son:

En el inventario DARH figuran todas la cuencas com de origen pluvial.

Dada la baja altitud que alcanzan las cimas circundantes, no existen glaciares ni nieves en las cuencas.^[3]​^: 2–77

Existen canales de riego, 5 embalses y 4 plantas de tratamiento de aguas servidas.^[3]​^: 2-78ff

El Atlas agroclimático de Chile distingue 6 distritos agroclimáticos en la cuenca:

•      4-2 Desierto con influencia marina y régimen de humedad xérico (BWnXe). La temperatura oscila entre un máximo de enero de 25,1 °C y un mínimo de julio de 8,2 °C. En todo el año no tiene heladas. El periodo de temperaturas favorables a la actividad vegetativa dura 12 meses. Registra anualmente 1.878 días grado y 57 horas de frío acumuladas hasta el 31 de Julio. La precipitación media anual es de 104 mm y un periodo seco de 12 meses, con un déficit hídrico de 1.182 mm/año. El período húmedo dura 0 meses durante los cuales se produce un excedente hídrico de 0 mm.
•      4-6 Desierto interior y régimen de humedad xérico (BWXe). La temperatura oscila entre un máximo de enero de 28,4 °C y un mínimo de julio de 5,6 °C. Tiene un promedio de 302 días consecutivos libres de heladas. En el año se registra un promedio de 4 heladas. El periodo de temperaturas favorables a la actividad vegetativa dura 12 meses. Registra anualmente 2.094 días grado y 243 horas de frío acumuladas hasta el 31 de Julio. La precipitación media anual es de 97 mm y un periodo seco de 12 meses, con un déficit hídrico de 1.622 mm/año. El período húmedo dura 0 meses durante los cuales se produce un excedente hídrico de 0 mm.
•      3-4-1 Desierto con influencia marina y régimen de humedad Xérico (BWnXe). La temperatura oscila entre un máximo de enero de 23 °C y un mínimo de julio de 7,6 °C. Tiene un promedio de 345 días consecutivos libres de heladas. En el año se registra un promedio de 0 heladas. El periodo de temperaturas favorables a la actividad vegetativa dura 12 meses. Registra anualmente 1.621 días grado y 100 horas de frío acumuladas hasta el 31 de Julio. La precipitación media anual es de 87 mm y un periodo seco de 12 meses, con un déficit hídrico de 1.167 mm/año. El período húmedo dura 0 meses durante los cuales se produce un excedente hídrico de 0 mm.
•      3-4-2 Desierto con influencia marina y régimen de humedad Xérico (BWnXe). La temperatura oscila entre un máximo de enero de 26,3 °C y un mínimo de julio de 7,4 °C. Tiene un promedio de 345 días consecutivos libres de heladas. En el año se registra un promedio de 0 heladas. El periodo de temperaturas favorables a la actividad vegetativa dura 12 meses. Registra anualmente 2.065 días grado y 91 horas de frío acumuladas hasta el 31 de Julio. La precipitación media anual es de 66 mm y un periodo seco de 12 meses, con un déficit hídrico de 1.382 mm/año. El período húmedo dura 0 meses durante los cuales se produce un excedente hídrico de 0 mm.
•      3-4-3 Desierto con influencia marina y régimen de humedad Xérico (BWnXe). La temperatura oscila entre un máximo de enero de 28,4 °C y un mínimo de julio de 6,5 °C. Tiene un promedio de 339 días consecutivos libres de heladas. En el año se registra un promedio de 1 helada. El periodo de temperaturas favorables a la actividad vegetativa dura 12 meses. Registra anualmente 2.171 días grado y 158 horas de frío acumuladas hasta el 31 de Julio. La precipitación media anual es de 109 mm y un periodo seco de 12 meses, con un déficit hídrico de 1.483 mm/año. El período húmedo dura 0 meses durante los cuales se produce un excedente hídrico de 0 mm.
•      3-4-4 Desierto con influencia marina y régimen de humedad xérico (BWnXe). La temperatura oscila entre un máximo de enero de 27,8 °C y un mínimo de julio de 8 °C. En todo el año no tiene heladas. El periodo de temperaturas favorables a la actividad vegetativa dura 12 meses. Registra anualmente 2.333 días grado y 53 horas de frío acumuladas hasta el 31 de Julio. La precipitación media anual es de 37 mm y un periodo seco de 12 meses, con un déficit hídrico de 1.482 mm/año. El período húmedo dura 0 meses durante los cuales se produce un excedente hídrico de 0 mm.

La economía de la zona se centra en las actividades de pesca, acuicultura, pequeña y mediana minería, turismo, y agricultura.^[3]​^: 2–47

El Ministerio del Medio Ambiente registra dos espacios protegidos en las cuencas, el parque nacional Bosque Fray Jorge y el santuario de la naturaleza Humedales de Tongoy.^[2]​

• Sistema de información y monitoreo de biodiversidad. Cuencas costeras entre los ríos Elqui y Limarí. Santiago de Chile. 
• Dirección General de Aguas (2014-cart). Anexo cartográfico nuevo inventario (DARH) SDT 356. Chile. Archivado desde el original el 27 de noviembre de 2023. 
• Ministerio de Obras Públicas de Chile, Dirección General de Aguas (2014). Informe técnico: Inventario de cuencas, subcuencas y subsubcuencas de Chile], División de Estudios y Planificación, SDT N° 364. Santiago de Chile. Archivado desde el original el 30 de marzo de 2019.