La cuenca tiene un relleno sedimentario que se divide en una parte de edad paleozoica y otra de edad meso-cenozoica.[1] Se suele considerar que la cuenca consiste de dos sbucuencas; la subcuenca de Jandiatuba al oeste y la subcuenca del Yuruá al este. Entre ambas subcuencas se encuentra el alto de Carauri.[3]
↑ abCaputo, Mário Vicente; Soares, Emilio A.A. (2016). «Eustatic and tectonic change effects in the reversion of the transcontinental Amazon River drainage system». Brazilian Journal of Geology46 (2): : 301-328. doi:10.1590/2317-4889201620160066.