El club fue nombrado Deportivo Itapuense por el nombre del departamento al que pertenece, el Departamento de Itapúa, "Itapúa" también era el antiguo nombre que se le daba a la ciudad de Encarnación.[2] De hecho, sus colores principales son el verde, blanco y rojo que son los colores de la bandera de Itapúa.[3][4]
El club posee una pequeña cancha propia en la ciudad de Encarnación, pero debido a su reducida capacidad suele oficiar sus partidos de local en otros estadios como el Estadio Villa Alegre, del Encarnación FC, el cual posee una capacidad para 16.000 espectadores o el Estadio Bosque del Mboi Ka'e, del 22 de Septiembre FBC, con capacidad para 3.000 espectadores.[10]
Palmarés
Nacionales
Primera División B Nacional (Tercera División) (1):2021.[6]
