La división de futsal FIFA del Club Cerro Porteño representa al club en dicha disciplina. Compite actualmente en la Liga Premium de Futsal, máximo torneo profesional de clubes de futsal del Paraguay, donde ha sido campeón en todas las ediciones de la misma, alcanzando nueve títulos absolutos de liga hasta el 2024. De aquí el apodo "Los Dueños del Futsal".[1][2]
Así también, se consagro campeón de la primera edición de la Copa Paraguay de Futsal FIFA en el 2018.
En el 2016, Cerro Porteño se coronó campeón de la Copa Libertadores de Futsal, convirtiéndose en el primer equipo paraguayo y el primer equipo no brasilero en adjudicarse este certamen.[3] También fue finalista de este certamen en las ediciones 2017 y 2019.
En la rama femenina el Club Cerro Porteño es bicampeón del Campeonato Femenino de Futsal, se corono en las ediciones 2018 y 2019.
_pictogram.svg){kind=small}
