El Salvador se encuentra en la zona climática tropical, que presenta condiciones térmicas similares durante todo el año. Debido a su posición en la franja costera de océano Pacífico tiene oscilaciones anuales importantes, debido a la brisa marina que transporta humedad y calor. El Salvador se encuentra en la ecozona Neotropical. Por su posición, El Salvador recibe el impacto frecuente de los huracanes que se generan en el Atlántico y las sequías provocadas por El Niño.^[1]​

El clima típico de El Salvador es el clima tropical seco y húmedo, con dos estaciones bien marcadas una lluviosa, entre mayo y octubre, y otra seca, entre noviembre y abril. No obstante, el carácter montuoso del país provoca zonas climáticas más suaves que las del clima zonal, y así en la meseta interior, donde vive la mayor parte de la población, el clima es más templado y sano^[2]​^[1]​

sin embargo, Las cordilleras y la meseta central ocupan el 85% del territorio, con las tierras altas. El resto lo ocupa la llanura costera, eso debido a eso la mayor parte del territorio es templado y En las costas y tierras bajas el clima es caluroso y húmedo

Debido a su ubicación tropical, El Salvador posee únicamente dos estaciones bien definidas en casi todo el territorio: la época seca, durante esta época las lluvias que se registran son casi nulas y solo suceden en zonas montañosas más altas del país, y la época lluviosa, en la que se da un considerable aumento del régimen de lluvias, durante los meses invernales del hemisferio norte, la llegada de frentes fríos o la influencia de sus vaguadas prefrontales afectan las zonas montañosas del país como son la cordillera volcánica y la meseta central. Ambas tienen una duración de aproximadamente seis meses.

A la época seca se le denomina coloquialmente verano, debido a que es su equivalente estacional, en el que se da una reducción considerable de las precipitaciones, durante este periodo, las precipitaciones llegan a desaparecer lo que genera problemas de sequías.

Se presenta durante un periodo de seis meses que inicia en noviembre y termina en abril. El periodo más caluroso se da en marzo - abril, donde el calor puede ser incómodo. Según el Ministerio de Medio y Recursos Naturales (MARN) las temperaturas varían en intensidad; las bajas se han registrado en alguna oportunidad menos de 15 °C y las más altas han alcanzado 32 °C y hasta más en el mes de abril, donde la media máxima es de 30 °C.^[3]​

De manera similar, a la época lluviosa se le llama invierno, y es una estación con leves descensos en la temperatura y grandes aumentos en el régimen de precipitación y la velocidad del viento, generalmente en todo el territorio. Durante esta época son ocasionales las inundaciones, ocurridas tras los desbordes de ríos y quebradas, que se salen de su cauce por acción de las fuertes lluvias.

La estación húmeda o temporada de lluvia se inicia desde mayo hasta noviembre. Durante los últimos meses de octubre y noviembre se presentan vientos pronunciados de manera moderada y por ratos fuertes, que generan frescura al ambiente^[3]​

En El Salvador, el clima cambia por altitud, lo cual existen regiones climáticas:^[4]​

Promedio de temperatura va disminuyendo con la altura de 27 a 22 °C en las planicies costeras y de 28 a 22 °C en las planicies internas.

El promedio de temperatura disminuye con la altura de 22 a 20 °C en las planicies altas y de 21 a 19 °C en las faldas de montañas.

De 20 a 16 °C en planicies altas y valles, de 21 a 19 °C en faldas de montañas y de 16 a 10 °C en valles y hondonadas sobre 1,800 metros, incluso a 8 °C.

Panorámica del Área Metropolitana de San Salvador (sin mostrar una parte de Antiguo Cuscatlán ni Santa Tecla, municipios de La Libertad que también forman parte del Gran San Salvador -derecha de la imagen-).

Parámetros climáticos promedio de San Salvador
Mes	Ene.	Feb.	Mar.	Abr.	May.	Jun.	Jul.	Ago.	Sep.	Oct.	Nov.	Dic.	Anual
Temp. máx. abs. (°C)	36.0	36.1	37.2	38.4	36.7	34.6	34.5	35.1	33.3	35.6	35.3	35.7	38.4
Temp. máx. media (°C)	30.3	30.1	32.0	32.2	30.8	29.5	30.1	30.0	29.0	29.1	28.0	28.6	30
Temp. media (°C)	22.2	22.8	23.8	24.5	24.2	23.3	23.3	23.2	22.8	22.8	22.4	22.0	23.1
Temp. mín. media (°C)	15.9	16.8	17.7	19.0	20.0	19.6	19.1	19.3	19.4	18.0	17.9	15.1	18.2
Temp. mín. abs. (°C)	7.2	9.4	7.2	12.2	14.4	13.3	14.4	15.6	11.7	12.2	9.4	8.3	7.2
Precipitación total (mm)	5.0	2.0	9.0	36.0	152.0	292.0	316.0	311.0	348.0	217.0	36.0	10.0	1734.0
Días de precipitaciones (≥ 1 mm)	1	1	1	5	13	20	20	20	20	16	4	2	123
Horas de sol	301	277	294	243	220	174	239	257	180	211	267	294	2957
Fuente n.º 1: World Meteorological Organization,[5]​ Sistema de Clasificación Bioclimática Mundial (extremes)[6]​
Fuente n.º 2: Danish Meteorological Institute (sun only)[7]​