Cereus hexagonus crece en forma de árbol ramificado, con tallos verticales que alcanzan un tamaño de hasta 15 metros de altura. El tallo es cilíndrico, segmentado, con un diámetro de hasta 12 centímetros y más. Tiene entre seis y ocho costillas, onduladas finas de 3-5 centímetros de alto. Las areolas son pequeñas. Los tallos pierden los espinos o tiene pocos disponibles. Las unidades mayores tienen de 8 a 10 o más espinas desiguales en cada areola. Al principio espinas marrones que son más brillantes más tarde, con 5 a 6 centímetros de largo. Las blancas flores miden de 20 a 25 centímetros de largo y los frutos de 5,5-13 centímetros de largo, en forma de huevo son de color rojo brillante. Contienen carne de un color un blanco o rosa.