La bandera usada por la marina mercante, como en todas las colonias y ex colonias británicas dispone de un fondo rojo (antiguo símbolo de la Marina Real Británica) con la Union Jack en la esquina superior izquierda y el Escudo Nacional a la derecha.
Por otro lado, el Gobernador de las Islas Vírgenes Británicas ostenta de una bandera separada, con la Union Jack de fondo y el escudo de armas de las Islas al centro.
