En 2001, un estudio ambiental de las aguas del Arroyo Canelón Chico realizado por el representante del Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente en Uruguay dio como resultado que hasta 9300 microgramos de fósforo por litro de agua.[3]
Acciones para la conservación
A partir del 2020 en adelante, se instauraron algunas políticas tendientes a la conservación del curso de agua y su entorno. En el 2022 se inaugura el "Sendero Interpretativo del Parque Artigas", en la ciudad de Canelones, con el objetivo de concientizar a la población local y visitantes sobre la importancia de conservar la buena salud de los ecosistemas locales, así como del impacto con el que se ha visto afectado el Arroyo debido a la explotación agropecuaria e industrial a lo largo del siglo XX.[4]