25 iglesias en toda la archidiócesis tienen la función de santuario (13 en la propia ciudad de Bolonia). Además del capítulo de la zona metropolitana, se tiene un capítulo de canónigos de la colegiata de San Petronio obispo, de Santa María la Mayor en la basílica de los Santos Bartolomé y Cayetano, San Giovanni in Persiceto (con la zona homónima), Santa María la Mayor (en Pieve di Cento), y San Biagio (en Cento).
El territorio de la archidiócesis se divide en 414 parroquias, agrupadas en 14 vicariatos: Bazzano, Bolonia Ravone, Bolonia Centro, Bolonia Nord, Bolonia Oeste, Bolonia Sudeste, Budrio, Castel San Pietro Terme, Cento, Galliera, Persiceto-Castelfranco, Porretta Terme, San Lazzaro-Castenaso, Setta y Vergato.
La provincia eclesiástica de Bolonia incluye las siguientes diócesis sufragáneas:
Las primeras noticias sobre los acontecimientos de la primera comunidad cristiana en Bolonia, son de finales del siglo III, con el martirio de tres de sus miembros: Vitale, Procolo y Agrícola.
No se sabe la fecha de la erección del obispado, pero por lo general es datada en el siglo III o siglo IV, cuando se tienen noticias del primer obispo, Zama. Desde el siglo IV era una diócesis sufragánea de Milán. Hacia el final del siglo V se convirtió en parte de la provincia eclesiástica de la arquidiócesis de Rávena.
Edad Media
En las luchas entre el Papado y el Imperio durante los siglos XI y XII y los años de gobierno de Federico Barbarroja, Bolonia permaneció fiel al papa, aunque a menudo el emperador consiguió obispos cismáticos opuestos a los obispos legítimos.
En 1088 es creada la Universidad de Bolonia, que probablemente tiene su origen en antiguas escuelas episcopales. Los exámenes finales y el reconocimiento de grados, eran tomados en la catedral desde comienzos del siglo XIII hasta el siglo XVIII. Muchas cátedras de la Universidad fueron confiadas al clero.
En 1106 se convirtió inmediatamente sujeta a la Santa Sede; el 7 de agosto de 1118 se convierte en como sufragánea de la arquidiócesis de Rávena.
En 1131 se celebró un acuerdo con la abadía de Nonantola, que había sido disuelta por la dependencia de la diócesis de Módena, y que estaba ansiosa por separarse. Según el acuerdo, los monjes de Nonantola a su vez, debían ser exclusivamente consagrados por los obispos de Bolonia.
En 1223, la noche de Navidad, un devastador terremoto destruyó las bóvedas de la catedral.
En 1306, Bolonia tomó las armas contra el cardenal legado apostólico Napoleón; teniendo como consecuencia, que la ciudad fuera excomulgada. La universidad fue cerrada y los maestros se trasladaron a Padua. Al año siguiente lograron la remisión, y reabrieron la universidad.
Últimos siglos
El 17 de mayo de 1567 se estableció en el seminario diocesano, como parte de las obras de renovación de la diócesis por el cardenal Gabriele Paleotti, de acuerdo con los decretos del Concilio de Trento.
En el siglo XVII se aumentaron las instituciones de caridad, llevando a mano la reconstrucción de los lugares de culto e intensificando las prácticas religiosas.
En 1723 se comenzó la construcción del Santuario de Nuestra Señora de San Luca, que fue consagrado en 1765. A lo largo del siglo, la Ilustración se opone al espíritu de un renovado celo pastoral, cuyas bisagras son las obras de caridad y el catecismo.
En 1796 los franceses introdujeron un nuevo orden político en la ciudad, contra la religión. En particular, las órdenes religiosas fueron suprimidas, las cofradías y las obras de caridad y asistencia fueron secularizadas, y se expulsó a los clérigos.
Una nueva ola de espíritu anticlerical golpeó la diócesis después de la anexión al Reino de Cerdeña en 1859: hasta 1882 a los arzobispos se les impidió residir en el palacio arzobispal, y se les obligó a vivir en el seminario. La diócesis respondió mediante la intensificación de las instituciones educativas y caritativas.
Los años del Concilio Vaticano II se caracterizaron por la presencia del cardenal Giacomo Lercaro, una de las figuras centrales del mismo Concilio, dándole gran impulso a la reforma litúrgica y al papel de los católicos en la política.
En 1989 el arzobispo cardenal Giacomo Biffi, cuyo episcopado se caracterizó por la riqueza teológica y doctrinal, dio la iniciativa de la creación del oratorio de Verano para Jóvenes, y que luego se extendió a lo largo de la Región de Emilia-Romaña, así como parte de Lombardía y Sicilia.