El apicoplasto es un orgánulo presente en la célula de la mayoría de los protistas llamados Apicomplexa (en español Apicomplejos), incluyendo Plasmodium, pero ausente en otras especies como Cryptosporidium.^[1]​^[2]​ Cada célula contiene un único apicoplasto y son homólogos a los cloroplastos de los dinoflagelados, pero han perdido la clorofila y carecen de la capacidad de fotosintetizar.^[3]​^[4]​ Sin embargo, son esenciales para la vida de los apicomplejos, pues no puede sobrevivir sin ellos. El hecho de que estén rodeados de cuatro membranas y contengan su propio genoma sugiere que proceden de cloroplastos obtenidos mediante la endosimbiosis secundaria de una alga eucariota. Más en detalle, los apicoplastos tienen las siguientes características:

• Es un orgánulo pequeño, pues tiene un diámetro de solo 0.15-1.5 μm.
• Está rodeado por cuatro membranas.
• Contiene su propio genoma: una molécula circular de ADN con un tamaño de 35.000 pares de bases que codifica aproximadamente 30 proteínas, un conjunto completo de ARNt y otras moléculas de ARN. Es capaz de reparar, replicar, transcribir y traducir sus genes.
• Puesto que 30 proteínas no son suficientes para la operación del apicoplasto, necesita importar otras proteínas (unas 500) del citplasma, codificadas por el genoma nuclear.
• Contiene partículas que se supone proceden de ribosomas de ascendencia bacteriana.
• Contiene "espirales tubulares" que se sospecha son vestigios de los tilacoides del antiguo cloroplasto.
• Entre sus funciones se encuentran la síntesis de ácidos grasos, isoprenoides y aminoácidos.

• Endosymbiosis and The Origin of Eukaryotes Archivado el 22 de junio de 2017 en Wayback Machine..