Era hijo de un matrimonio de campesinos acomodados, Pedro de Aragón y Elvira Martín. Quedó huérfano de padre a los pocos años y su madre volvió a casarse. Sus dos hermanos desaprobaron las nuevas nupcias de su madre, por lo que se emanciparon. Antón se trasladó a Madrid y decidió emprender la carrera militar, enrolándose en Valencia. Al conocer la muerte de su hermano Pedro en Granada, a manos del hermano de una mujer con quien había rechazado casarse, marchó a dicha ciudad a vengarle. Sin embargo, allí conoció a Juan de Dios, religioso dedicado a la caridad, que le convenció de que abandonara sus planes de venganza. Así lo hizo, y pidió públicamente la conmutación de la pena de muerte del asesino. Además se unió al religioso en su tarea asistencial en el Hospital de Granada; y a la muerte de aquel (8 de marzo de 1550) le fue encomendada la dirección de un grupo de padres hospitalarios que terminaron constituyéndose en la llamada Orden Hospitalaria de San Juan de Dios (Juan de Dios no sería beatificado hasta 1630 ni canonizado hasta 1690).
