Hannigan, hija única de la corredora de bienes raíces Emilie Posner y el camionero Al Hannigan,[1] es judía por parte de madre[2] y también tiene ascendencia irlandesa.[3] Un año después de su nacimiento, sus padres se separaron y ella se crio principalmente en Atlanta junto a su madre.
Asistió a la Escuela Preparatoria North Hollywood, donde audicionó con éxito para los agentes, mientras visitaba a su padre en Santa Bárbara. Estudió en la Universidad Estatal de California, Northridge.
Trayectoria
A pesar de haber aparecido en un filme industrial para Active Parenting y en un anuncio para las galletas Duncan Hines (1978), no comenzó oficialmente su carrera hasta 1985.
En 1989, consiguió su primer papel regular en Free Spirit (ABC). A lo largo de los 90 apareció en varios anuncios de televisión. Durante esa década también protagonizó varios telefilmes como Cambiadas al nacer (1991) o A case for life (1996).
En 1997, consiguió el papel de Willow Rosenberg en Buffy, la cazavampiros, serie que se convirtió en un éxito y que le sirvió el reconocimiento del público. En su recta final en la serie (2003), la actriz cobraba 250 000 dólares por episodio. Gracias a su trabajo en esta serie, Hannigan apareció en American Pie, American Pie 2, American Wedding y Boys and Girls. Recuperó su papel de Willow en la séptima temporada de la serie y en la cuarta del spin-off de ésta: Ángel.
Mantuvo una relación sentimental con Ginger Fish, de la banda Marilyn Manson.[5] Se casó con el actor Alexis Denisof el 11 de octubre de 2003 en el Two Brunch Palms Resort, en Desert Hot Springs. Ambos adquirieron una casa en Santa Mónica y el 24 de marzo de 2009, cumpleaños de Alyson, nació su primera hija: Satyana Denisof.[6]
A finales del 2011 (después de muchas especulaciones), la actriz confirmó en Twitter que está embarazada por segunda ocasión generando una gran polémica tras literalmente expresar "lo mucho que me la suda tener otro hijo de forma tan precipitada",[7] coincidiendo con el embarazo de su personaje Lily Aldrin en How I Met Your Mother. Su segunda hija, Keeva Jane, nació el 23 de mayo de 2012.