Το 1858 γνώρισε στη Ρώμη την Ελίζαμπεθ Έικερς Άλεν μία νεαρή μητέρα, δημοσιογράφο και ποιήτρια, την οποία παντρεύτηκε τον Αύγουστο του 1860 στο Χόλλις του Μέιν.[7] Το μοναδικό τους παιδί, η Γερτρούδη Ροδερμελ, πέθανε σε βρεφική ηλικία. Ο Έικερς απεβίωσε στη Φιλαδέλεφεια της Πενσυλβάνια, στις 21 Μαίου 1861 από φυματίωση.[8] Ο τάφος του βρίσκεται στο Κοιμητήριο Έβεργκριν του Πόρτλαντ.[9]