To Κύπελλο Ελλάδος καλαθοσφαίρισης ανδρών 1988-89 που διοργάνωσε η Ελληνική Ομοσπονδία Καλαθοσφαίρισης ξεκίνησε στις 5 Οκτωβρίου 1988 με τους αγώνες της πρώτης φάσης, στους οποίους μετείχαν οι ομάδες των χαμηλών εθνικών κατηγοριών (Β΄ Εθνική και Α2΄). Διεξήχθησαν δύο αγωνιστικές μέχρι να μείνουν έξι ομάδες. Στη Β΄ φάση εντάχθηκαν και οι 10 ομάδες της Α1΄ Εθνικής (σύνολο: 16 ομάδες). Τη σεζον αυτή οι προημιτελικοί και οι ημιτελικοί αγώνες ήταν διπλοί: εντός και εκτός έδρας. Ο τελικός διεξήχθη στις 13 Μαΐου 1989 στο Αλεξάνδρειο Μέλαθρο, με αντιπάλους τον ΠΑΟΚ και τον Άρη^[1]. Το κύπελλο Ελλάδος κατέκτησε ο Άρης Θεσσαλονίκης για τέταρτη φορά στην ιστορία της διοργάνωσης.

Ο Παναθηναϊκός δεν ταξίδεψε στην Θεσσαλονίκη για τον επαναληπτικό ημιτελικό, σε ένδειξη διαμαρτυρίας για την αντιμετώπιση που τύγχανε από τους διαιτητές καθ' όλη τη διάρκεια της αγωνιστικής περιόδου 1988-89.

• Αλεξάνδρειο Μέλαθρο.
• Τετάρτη, 13 Μαΐου 1989.
• Διαιτητές: Κόντης, Βιδάλης.
• Εισιτήρια: 5.085.

Άρης Θεσσαλονίκης	Σκορ	ΠΑΟΚ
Προπονητής: Γιάννης Ιωαννίδης Σύνθεση: Γκάλης 14, Γουίλτζερ 17, Γιαννάκης 13 (3 τρ.), Σούμποτιτς 13 (3 τρ.), Ρωμανίδης 6 (1 τρ.), Φιλίππου 3, Μισούνοφ 2, Μ. Κατσύλης, Δοξάκης, Δαλιάρης.	91 – 86 (ημ. 49–51)	Προπονητής: Κώστας Πολίτης Σύνθεση: Τζόουνς 31 (1 τρ.), Κόρφας 18 (2 τρ.), Σταυρόπουλος 12 (2 τρ.), Πρέλεβιτς 8, Φασούλας 7, Μακαράς 7 (1 τρ.), Καρατζουλίδης 2, Μέλις 1, Μπακόπουλος (Δόντσιος).

Κυπελλούχος Ελλάδος καλαθοσφαίρισης ανδρών 1989
Άρης Θεσσαλονίκης

• Ελληνική Ομοσπονδία Καλαθοσφαίρισης