Bis zum Jahre 770 hieß der Ort Pisinhaim, was um 856 zu Piscenheim und um 898 zu Pissunhaim wurde. Der mittelfränkischen Dialektgruppe ist der spätere Name Pissenheim zu verdanken. 1934 wurde der Ort nach seiner ältesten Hofanlage, dem aus einem fränkischen Gutshof entstandenen „Werther Hof“, in Werthhoven umbenannt. Der oft falsch verstandene, als anrüchig empfundene einstige Name Werthhovens spiegelt sich heute in der umgangssprachlichen Bezeichnung Pössem wider.
Innerhalb der Gemeinde Wachtberg bilden die Ortschaften Ortsausschüsse. Der Ortsausschuss Werthhoven hat zehn Mitglieder. Vorsitzender ist Steffen Kömpel (CDU), sein Stellvertreter Siegfried Vogel (Unser Wachtberg).[3]