Stephen Ameyu empfing am 21. April 1991 das Sakrament der Priesterweihe für das Bistum Torit.[1] Nach pastoralen Aufgaben in der sudanesischen Hauptstadt Khartum war er von 1993 bis 1997 zum Doktoratsstudium an der Päpstlichen Universität Urbaniana in Rom. Seine Dissertation trägt den Titel Towards Religious Dialogue and Reconciliation in Sudan.[2] Anschließend lehrte Ameyu am Priesterseminar von Juba, der Hauptstadt des Südsudan, und war zuletzt auch dessen Dekan. Seit 2013 arbeitete er zudem in der Verwaltung der Katholischen Universität von Südsudan.
Am 3. Januar 2019 ernannte ihn Papst Franziskus zum Bischof von Torit, nachdem dieses Bistum seit dem Tod von Bischof Akio Johnson Mutek 2013 mehr als fünf Jahre vakant geblieben war.[1] Die Bischofsweihe spendete ihm der Erzbischof von Juba, Paulino Lukudu LoroMCCI, am 3. März desselben Jahres. Mitkonsekratoren waren der Erzbischof von Khartum, Michael Didi Adgum Mangoria, und der Bischof von Yei, Erkolano Lodu Tombe. Noch im selben Jahr, am 12. Dezember 2019, ernannte ihn Papst Franziskus zum Erzbischof von Juba.[3] Die Amtseinführung fand am 22. März des folgenden Jahres statt. Mit gleichem Datum wurde er zum Apostolischen Administrator des Bistums Torit ernannt, das er bis zum Amtsantritt seines Nachfolgers Emmanuel Bernardino Lowi Napeta am 15. Januar 2023 verwaltete. Vom 21. September 2020 bis 24. Januar 2021 war er außerdem Apostolischer Administrator des Bistums Wau.
↑Stephen Ameyu: Towards Religious Dialogue and Reconciliation in Sudan. Pontificia Universitas Urbaniana, Rom 1997, OCLC52961305 (englisch, IX, 79 S., Exzerpt).