Das Museum wurde im Jahre 1904 als städtisches Museum vom Finanzbeamten und Regionalhistoriker Rudolf Merbeller gegründet. Im Jahr 1946 wurde es im Sitter-Haus eingerichtet.
Sammlungen
Nach einer Gesamtrenovierung des Gebäudes wurden die Sammlungen nach 1992 neu gestaltet. Zahlreiche Zeitabschnitte werden durch lebensgroße Figuren veranschaulicht. Für die Besucher gibt es neben Sonderausstellungen eine Dauerausstellung zu folgenden Themen:
Geschichte der Handelsstraße Goldener Steig, mit archäologischen Zeugnissen
Darstellung der Stadtgeschichte von Prachatice und seiner Zünfte unter wechselnden Ortsherren
Goldenes Zeitalter mit der Erhebung zur „königlichen Stadt“ 1609