Dem SEGOB untersteht das „Untersekretariat der Regierung“ (Subsecretaría de Gobierno) und das Subsecretaría de Enlace Legislativo, das sich mit Aufgaben im Zusammenhang mit der Gesetzgebung befasst. Mit juristischen Angelegenheiten und Menschenrechten befasst sich das Subsecretaría de Asuntos Jurídicos y Derechos Humanos und das Subsecretaría de Población, Migración y Asuntos Religiosos mit den Themengebieten Population, Migration und religiöse Angelegenheiten. Neben einem weiteren Untersekretariat „Normativität der Mittel“ (Normatividad de Medios) gehört zum SEGOB noch die Generalkoordinierungsstelle für Zivilschutz (Coordinación General de Protección Civil).
Ferner ist dem Sekretariat auch die Generaldirektion für Medien, die Dirección General de Radio, Televisión y Cinematografía (RTC), und der mexikanische Geheimdienst, das Centro de Investigación y Seguridad Nacional (CISEN) unterstellt.
Bisherige Sekretäre
Das Amt eines „Secretario“ / einer „Secretaria“ der Regierung in Mexiko ist vergleichbar mit dem eines Ministers einer Staatsregierung.
