Saint-Clair-sur-l’Elle liegt etwa neun Kilometer nordnordöstlich von Saint-Lô. Der Fluss Elle begrenzt die Gemeinde im Nordosten. Umgeben wird Saint-Clair-sur-l’Elle von den Nachbargemeinden Moon-sur-Elle im Norden und Westen, Saint-Jean-de-Savigny im Osten, Couvains im Südosten, Villiers-Fossard im Süden sowie La Meauffe im Südwesten.