Am 31. Juli 1987 bestellte ihn Johannes Paul II. zum Bischof von Autun. In der Französischen Bischofskonferenz war Séguy Mitglied der bischöflichen Kommission für den ländlichen Raum und des bischöflichen Finanzkomitees.
Papst Benedikt XVI. nahm am 8. April 2006 sein altersbedingtes Rücktrittsgesuch an.[2] Raymond Séguy starb am 21. März 2022 im Alter von 92 Jahren in Rodez und wurde in der Kathedrale von Autun beigesetzt.[3]
Schriften
Gaston Alary, Raymond Séguy, André Serres: A. Bion: prêtre du Rouergue (1913–1967). Impr. Carrère, Rodez 1972, OCLC743101455.
Chemin de Sainteté en terre bourguignonne (deutschWeg der Heiligkeit auf burgundischem Boden)